探索是《Walkr - 口袋裡的銀河冒險》的遊戲重點之一，玩家必須發射「探索號」來搜尋未知的星系，玩家每次搜尋的時候，都可以選擇元素星系、動物星系、植物星系或美食星系，如果不知道要選什麼，也可以選擇「隨機探索」，而且只有選擇了隨機探索，才有可能發現稀有的「特殊星系」中的星球喔！

隨著太空船越飛越遠，玩家就會需要更多的金幣來執行探索任務。為了要賺取金幣，玩家必須要打造食物生產機（DFR）來餵養各個星球的外星生物，而生物們會給予資源做為回報。玩家可以直接把資源賣掉作為金幣，累積飛往下顆星球的基金。